Стоян Андонов е назначен за заместник-министър на младежта и спорта. Андонов е доцент в катедра „Водни спортове“ в НСА „Васил Левски“. От 1993 до 2006 г е директор на дирекция „Водноспасителна служба“ в Български Червен кръст. От 2018 г. до 2021 г. е заместник-министър на младежта и спорта.
Доц. Стоян Андонов е майстор на спорта по плуване и световен шампион по водно-спасителен многобой. В периода 1983-1985 г. е треньор по плуване в ДФС „Левски Спартак“, а като наставник на мъжкия национален отбор по водно спасяване в периода 1987-1991 е европейски шампион (1988 г.). Научните интереси на доц. Андонов и публикациите му са свързани със сферата на плуването и водното спасяване.
Владее руски език и използва английски и немски език.
